Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRSQ13332 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRSQ13332 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRSQ13332 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRSQ13332 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRSQ13332 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRSQ13332 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRSQ13332 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPRSQ13332 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms