Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CAMTA2-202ENST00000361571 4777 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 TTC28-AS1-205ENST00000425112 807 ntTSL 312.57□□□□□ -0.41e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TTC28-AS1-214ENST00000435348 578 ntTSL 412.43□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 ECM1-201ENST00000346569 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.436e-8■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CAMTA2-203ENST00000381311 4374 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 TPK1-213ENST00000552881 581 ntTSL 411.98□□□□□ -0.491e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TBRG1-203ENST00000441174 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TPK1-203ENST00000378099 2283 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 XPNPEP1-213ENST00000488118 4384 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 RPL26L1-206ENST00000521476 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.523e-8■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TPK1-201ENST00000360057 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.531e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MBTPS2-202ENST00000379484 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 STX4-207ENST00000475862 604 ntTSL 511.4□□□□□ -0.581e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 HSD17B7-201ENST00000254521 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 AC004448.4-203ENST00000456537 441 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 EEF1A1P10-201ENST00000475365 1390 ntBASIC9.86□□□□□ -0.831e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 AC004448.4-201ENST00000627753 580 ntTSL 59.79□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 TPK1-202ENST00000378098 1920 ntTSL 1 (best)9.39□□□□□ -0.911e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 HINT2-203ENST00000471774 443 ntTSL 37.84□□□□□ -1.153e-12■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SRRD-202ENST00000471799 668 ntTSL 27.69□□□□□ -1.181e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 TPK1-205ENST00000482940 2815 ntTSL 1 (best)7.34□□□□□ -1.231e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.652e-23■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.791e-6■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 28.4
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PABPC4Q13310 PKMYT1-219ENST00000575981 910 ntTSL 222.73■■□□□ 1.232e-73■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.162e-73■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.912e-73■■■■■ 28.4
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PABPC4Q13310 BLVRB-203ENST00000597870 1392 ntTSL 522.05■■□□□ 1.122e-22■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.582e-22■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.072e-22■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 BLVRB-204ENST00000601346 676 ntTSL 214.89□□□□□ -0.032e-22■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 BAD-204ENST00000492141 359 ntTSL 519.06■□□□□ 0.642e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 BAD-205ENST00000493798 325 ntTSL 217.8■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.91e-6■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 PSMB1-201ENST00000262193 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.327e-40■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 HEMGN-201ENST00000259456 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.493e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.65e-6■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.175e-6■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 RNF7-203ENST00000477012 1036 ntTSL 1 (best)19.93■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.684e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 RNF7-204ENST00000477393 862 ntTSL 218.69■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.285e-6■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.15e-6■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.034e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 RNF7-202ENST00000393000 805 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.074e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 ADGRE5-202ENST00000357355 3054 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 ADGRE5-201ENST00000242786 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 28.4
PABPC4Q13310 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.864e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 28.3
PABPC4Q13310 WDR48-208ENST00000466405 4925 ntTSL 1 (best)7.02□□□□□ -1.292e-10■■■■■ 28.3
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