Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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SCGB2A2Q13296 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SCGB2A2Q13296 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SCGB2A2Q13296 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
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