Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEMA3FQ13275 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3FQ13275 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3FQ13275 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms