Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SRSF6Q13247 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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