Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NME3Q13232 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NME3Q13232 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME3Q13232 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME3Q13232 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME3Q13232 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME3Q13232 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME3Q13232 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME3Q13232 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME3Q13232 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME3Q13232 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NME3Q13232 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NME3Q13232 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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