Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERCC8Q13216 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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ERCC8Q13216 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERCC8Q13216 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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