Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CHAF1BQ13112 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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