Protein–RNA interactions for Protein: Q12882

DPYD, Dihydropyrimidine dehydrogenase [NADP(+)], humanhuman

Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPYDQ12882 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DPYDQ12882 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
DPYDQ12882 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms