Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CDH17Q12864 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDH17Q12864 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH17Q12864 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH17Q12864 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH17Q12864 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH17Q12864 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDH17Q12864 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
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