Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BPTFQ12830 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
BPTFQ12830 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BPTFQ12830 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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