Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
NUP160Q12769 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
NUP160Q12769 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NUP160Q12769 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms