Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 YDR271CYDR271C 372 nt3.3□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 TCA17YEL048C 459 nt3.3□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YKL162CYKL162C 1209 nt3.3□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 MTR2YKL186C 555 nt3.3□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 COQ5YML110C 924 nt3.3□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YIP3YNL044W 531 nt3.3□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YOR186WYOR186W 435 nt3.3□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 PTM1YKL039W 1572 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 SSL1YLR005W 1386 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 TRE2YOR256C 2430 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 KAR1YNL188W 1302 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 TOS8YGL096W 831 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 GSP1YLR293C 660 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YLR311CYLR311C 348 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 ECM8YBR076W 1065 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YBR089WYBR089W 600 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 RRP7YCL031C 894 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 BUD6YLR319C 2367 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 PDR12YPL058C 4536 nt3.29□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 PRS5YOL061W 1491 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 AIP1YMR092C 1848 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 ROK1YGL171W 1695 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 RDI1YDL135C 609 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 PAN5YHR063C 1140 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 RSM25YIL093C 795 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 ARG3YJL088W 1017 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YAR075WYAR075W 474 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 URA4YLR420W 1095 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 MED11YMR112C 396 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 MRPS8YMR158W 468 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 TRI1YMR233W 681 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 COS1YNL336W 1146 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 RPS7AYOR096W 573 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YOR263CYOR263C 408 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 PET20YPL159C 762 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 SUT2YPR009W 807 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YBR096WYBR096W 693 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 CSH1YBR161W 1131 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 YFL040WYFL040W 1623 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 RPN4YDL020C 1596 nt3.28□□□□□ -1.88
HMS1Q12398 SSE2YBR169C 2082 nt3.28□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 TCB3YML072C 4638 nt3.28□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 DSN1YIR010W 1731 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 CDC45YLR103C 1953 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 RRP14YKL082C 1305 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 SPA2YLL021W 4401 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 POL1YNL102W 4407 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 MRPL32YCR003W 552 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 HOM2YDR158W 1098 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 TRP4YDR354W 1143 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 GLC3YEL011W 2115 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YHI9YHR029C 885 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YIR040CYIR040C 333 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 ALB1YJL122W 528 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 SED5YLR026C 1023 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YML053CYML053C 639 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 IZH4YOL101C 939 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 OSW1YOR255W 837 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 PRP3YDR473C 1410 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 MTR4YJL050W 3222 nt3.27□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 PUB1YNL016W 1362 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 PLM2YDR501W 1566 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 MTH1YDR277C 1302 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YNR066CYNR066C 1311 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 RCR2YDR003W 633 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 PNO1YOR145C 825 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 FDH1YOR388C 1131 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 RPS11BYBR048W 471 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YPL168WYPL168W 1293 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 POF1YCL047C 777 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 UBP12YJL197W 3765 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 GWT1YJL091C 1473 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 OSH3YHR073W 2991 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 CIT1YNR001C 1440 nt3.26□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 UBX5YDR330W 1503 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 CET1YPL228W 1650 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 FAD1YDL045C 921 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 IES6YEL044W 501 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 USE1YGL098W 738 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YGR051CYGR051C 324 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 PCL7YIL050W 858 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 DPH1YIL103W 1278 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 ANB1YJR047C 474 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 RPS28BYLR264W 204 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YML047W-AYML047W-A 366 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 RUF21RUF21 707 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 RPC34YNR003C 954 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YOL118CYOL118C 309 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YOR114WYOR114W 885 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 PIN3YPR154W 648 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 RPS9BYBR189W 588 nt3.25□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 GRX3YDR098C 858 nt3.24□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 IZH1YDR492W 951 nt3.24□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YDR535CYDR535C 501 nt3.24□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 RPS0AYGR214W 759 nt3.24□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt3.24□□□□□ -1.89
HMS1Q12398 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms