Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 HIT1YJR055W 495 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YET1YKL065C 621 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YML009C-AYML009C-A 327 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 OCA2YNL056W 594 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 MSN1YOL116W 1149 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YOR053WYOR053W 342 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 APD1YBR151W 951 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 CCZ1YBR131W 2115 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 THR4YCR053W 1545 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 FMP30YPL103C 1407 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 AFR1YDR085C 1863 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 MPH2YDL247W 1830 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 PIF1YML061C 2580 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YDL187CYDL187C 330 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 PRM8YGL053W 714 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ZRT1YGL255W 1131 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 SPG1YGR236C 288 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YJL028WYJL028W 336 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 AHP1YLR109W 531 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 SEC13YLR208W 894 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 PBI2YNL015W 228 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 RNH201YNL072W 924 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 MCK1YNL307C 1128 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ERI1YPL096C-A 207 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 RPL19AYBR084C-A 570 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 BUL1YMR275C 2931 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YIR007WYIR007W 2295 nt5.07□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 IOC4YMR044W 1428 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 MNN2YBR015C 1794 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 HAP4YKL109W 1665 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 VBA1YMR088C 1689 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 OCT1YKL134C 2319 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 PMP3YDR276C 168 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ERP1YAR002C-A 660 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YAR023CYAR023C 540 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 CUZ1YNL155W 825 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 MRP21YBL090W 534 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 RPS15YOL040C 429 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ICY2YPL250C 411 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YBR285WYBR285W 435 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 FLC3YGL139W 2409 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ABZ1YNR033W 2364 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 DSS1YMR287C 2910 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YCR101CYCR101C 549 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 GPI19YDR437W 423 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 SPG3YDR504C 384 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 CHZ1YER030W 462 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 QCR10YHR001W-A 234 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YLR294CYLR294C 330 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YLR296WYLR296W 327 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YLR463CYLR463C 552 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YMR087WYMR087W 855 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YRO2YBR054W 1035 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YPL225WYPL225W 441 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ARR2YPR200C 393 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 GPT2YKR067W 2232 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YAP1801YHR161C 1914 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 SIA1YOR137C 1869 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 SAT4YCR008W 1812 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 XKS1YGR194C 1803 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 MMT1YMR177W 1533 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 GLO2YDR272W 825 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 SOH1YGL127C 384 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YJR128WYJR128W 360 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 RHO4YKR055W 876 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 SHP1YBL058W 1272 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YNR034W-AYNR034W-A 297 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YPR170CYPR170C 336 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 PLM2YDR501W 1566 nt5.04□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 BRE2YLR015W 1518 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YMR046CYMR046C 1323 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 YDR491CYDR491C 492 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 MAM33YIL070C 801 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 PDB1YBR221C 1101 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 ACC1YNR016C 6702 nt5.03□□□□□ -1.6
TY1A-NL1Q12391 TAX4YJL083W 1815 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 LYS21YDL131W 1323 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 IMA2YOL157C 1770 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 JEM1YJL073W 1938 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 GIP1YBR045C 1920 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YDL071CYDL071C 375 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 CDC43YGL155W 1131 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 MIC26YGR235C 702 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 ENT3YJR125C 1227 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 MTC2YKL098W 1074 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YKT6YKL196C 603 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YBL044WYBL044W 369 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 TIF11YMR260C 462 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 RRT16YNL105W 429 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YNL235CYNL235C 432 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 COQ10YOL008W 624 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 MCM16YPR046W 546 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 MSS18YPR134W 807 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 ERG4YGL012W 1422 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 ASF2YDL197C 1578 nt5.02□□□□□ -1.61
TY1A-NL1Q12391 YCT1YLL055W 1596 nt5.02□□□□□ -1.61
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