Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 DIP2YLR129W 2832 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 TRS85YDR108W 2097 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 YOL075CYOL075C 3885 nt4.66□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 FKH2YNL068C 2589 nt4.65□□□□□ -1.66
CLF1Q12309 NRG1YDR043C 696 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YEL010WYEL010W 351 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YFL019CYFL019C 354 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 PRE9YGR135W 777 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 COS8YHL048W 1146 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 PIR3YKL163W 978 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 MRPL16YBL038W 699 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SUI1YNL244C 327 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 PFK27YOL136C 1194 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 RET3YPL010W 570 nt4.65□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 REF2YDR195W 1602 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 GLO3YER122C 1482 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YDR391CYDR391C 699 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 PRP38YGR075C 729 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 ECM34YHL043W 513 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 UTP11YKL099C 753 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YLR456WYLR456W 615 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 INP1YMR204C 1263 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YPL025CYPL025C 558 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YIG1YPL201C 1386 nt4.64□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 KIC1YHR102W 3243 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 TAF7YMR227C 1773 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SMP3YOR149C 1551 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SHU2YDR078C 672 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 ERJ5YFR041C 888 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 GVP36YIL041W 981 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 OAR1YKL055C 837 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 RRP36YOR287C 903 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 ATG5YPL149W 885 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 UTP5YDR398W 1932 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 CTR86YCR054C 1692 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 RNA14YMR061W 2034 nt4.63□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YCR023CYCR023C 1836 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 MSN4YKL062W 1893 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 QRI7YDL104C 1224 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 THI13YDL244W 1023 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SLX8YER116C 825 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 DOG2YHR043C 741 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 DOG1YHR044C 741 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 FMC1YIL098C 468 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 THI11YJR156C 1023 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 EOS1YNL080C 1101 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YOR238WYOR238W 912 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YOR283WYOR283W 693 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 PNG1YPL096W 1092 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YNL011CYNL011C 1335 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 RIA1YNL163C 3333 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 TAF8YML114C 1533 nt4.62□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YJR061WYJR061W 2808 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YDR133CYDR133C 336 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 ATC1YDR184C 885 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SPI1YER150W 447 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YGL132WYGL132W 336 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 OST5YGL226C-A 261 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 FOL2YGR267C 732 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 CDC12YHR107C 1224 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 PFS1YHR185C 714 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YLR444CYLR444C 303 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 MCK1YNL307C 1128 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SPT23YKL020C 3249 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 NTA1YJR062C 1374 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 CTF13YMR094W 1437 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 CTK1YKL139W 1587 nt4.61□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 HOYDL227C 1761 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 MCD4YKL165C 2760 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SEN1YLR430W 6696 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 KIN4YOR233W 2403 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YCL076WYCL076W 744 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 ELO2YCR034W 1044 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SNU23YDL098C 585 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 HTB1YDR224C 396 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 COBQ0105 1158 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YFH7YFR007W 1062 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YGK3YOL128C 1128 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YAR1YPL239W 603 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 CIN2YPL241C 807 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 FDH2YPL275W 711 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 MUD1YBR119W 897 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SEG1YMR086W 2883 nt4.6□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 CRD1YDL142C 852 nt4.59□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 LSM4YER112W 564 nt4.59□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SCEIQ0160 708 nt4.59□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 YML047W-AYML047W-A 366 nt4.59□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 SME1YOR159C 285 nt4.59□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 KRE5YOR336W 4098 nt4.59□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 MRPL27YBR282W 441 nt4.59□□□□□ -1.67
CLF1Q12309 UPC2YDR213W 2742 nt4.59□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 USA1YML029W 2517 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 SEC2YNL272C 2280 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 MAL12YGR292W 1755 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 MAL32YBR299W 1755 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 GCD1YOR260W 1737 nt4.58□□□□□ -1.68
CLF1Q12309 RUB1YDR139C 234 nt4.58□□□□□ -1.68
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