Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YML133W-BYML133W-B 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 PRX1YBL064C 786 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 ASI2YNL159C 870 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YNL339W-BYNL339W-B 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YBL113W-AYBL113W-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YOR396C-AYOR396C-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YRO2YBR054W 1035 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YPL283W-BYPL283W-B 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YPR050CYPR050C 414 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YPR204C-AYPR204C-A 483 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 SST2YLR452C 2097 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 KIN3YAR018C 1308 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 SEC20YDR498C 1152 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 AST2YER101C 1293 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YGR017WYGR017W 894 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YGR035CYGR035C 351 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 QCR10YHR001W-A 234 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 SDL1YIL167W 633 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YIR042CYIR042C 711 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YKL153WYKL153W 510 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YMR252CYMR252C 405 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 RPN3YER021W 1572 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 ACS1YAL054C 2142 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 TSR1YDL060W 2367 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 HRR25YPL204W 1485 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 PRY3YJL078C 2646 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YOL036WYOL036W 2286 nt5.57□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 PXL1YKR090W 2121 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 IMG1YCR046C 510 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YDR187CYDR187C 519 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 CUP2YGL166W 678 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 OAR1YKL055C 837 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 ERP1YAR002C-A 660 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YNL235CYNL235C 432 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 IRC16YPR038W 360 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YPR123CYPR123C 435 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 EKI1YDR147W 1605 nt5.56□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 KEL1YHR158C 3495 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 RFT1YBL020W 1725 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 UBC8YEL012W 657 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YGR151CYGR151C 336 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 RTS3YGR161C 792 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YJL182CYJL182C 318 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 RPS28AYOR167C 204 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YMR279CYMR279C 1623 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 SAS10YDL153C 1833 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 BAP2YBR068C 1830 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YCT1YLL055W 1596 nt5.55□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 ESC8YOL017W 2145 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 ALT2YDR111C 1524 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 AFG1YEL052W 1530 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 PDR18YNR070W 4002 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 PDP3YLR455W 915 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 SCS22YBL091C-A 528 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 RMD9YGL107C 1941 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 YTP1YNL237W 1380 nt5.54□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 VPS5YOR069W 2028 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 LYS9YNR050C 1341 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 PGK1YCR012W 1251 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 PBP4YDL053C 558 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 DPP1YDR284C 870 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 MRS1YIR021W 1092 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 ATP18YML081C-A 180 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 AYT1YLL063C 1425 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 CDC14YFR028C 1656 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 HIS7YBR248C 1659 nt5.53□□□□□ -1.52
TY1A-BLQ12266 RIX7YLL034C 2514 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 ADE12YNL220W 1302 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 KTR5YNL029C 1569 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 snR82snR82 268 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 SDH4YDR178W 546 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 TIP20YGL145W 2106 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 YAL004WYAL004W 648 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 GRX7YBR014C 612 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 YPL109CYPL109C 1974 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 JEM1YJL073W 1938 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 MRC1YCL061C 3291 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 PYC2YBR218C 3543 nt5.52□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 MSN2YMR037C 2115 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 PMP3YDR276C 168 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 ISD11YER048W-A 285 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 YGR265WYGR265W 411 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 DBP8YHR169W 1296 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 YAR023CYAR023C 540 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 YML108WYML108W 318 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 RNH201YNL072W 924 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 RPS3YNL178W 723 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 SEC18YBR080C 2277 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 NEL1YHR035W 1893 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 POL31YJR006W 1464 nt5.51□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 SPH1YLR313C 1593 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 OSW2YLR054C 2175 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 ASA1YPR085C 1332 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 RKM3YBR030W 1659 nt5.5□□□□□ -1.53
TY1A-BLQ12266 BDP1YNL039W 1785 nt5.5□□□□□ -1.53
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