Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 SPN1YPR133C 1233 nt3.2□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 HPA2YPR193C 471 nt3.2□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 TOP1YOL006C 2310 nt3.2□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 MSA1YOR066W 1890 nt3.2□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 RRM3YHR031C 2172 nt3.19□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 RCY1YJL204C 2523 nt3.19□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YDL242WYDL242W 354 nt3.19□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YMR084WYMR084W 789 nt3.19□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YOL050CYOL050C 321 nt3.19□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 TCP1YDR212W 1680 nt3.19□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 MIG1YGL035C 1515 nt3.19□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 STP1YDR463W 1560 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YFT2YDR319C 825 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 FRQ1YDR373W 573 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YEL074WYEL074W 339 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YER147C-AYER147C-A 411 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 FUR1YHR128W 651 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 TMA19YKL056C 504 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 TPM1YNL079C 600 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 BUD21YOR078W 645 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 SAS5YOR213C 747 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 RPA135YPR010C 3612 nt3.18□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 CHS2YBR038W 2892 nt3.17□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 MSS2YDL107W 1056 nt3.17□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 PEX10YDR265W 1014 nt3.17□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 DYN2YDR424C 279 nt3.17□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YHP1YDR451C 1062 nt3.17□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YIL089WYIL089W 618 nt3.17□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 MCM1YMR043W 861 nt3.17□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YPK3YBR028C 1578 nt3.17□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 CLG1YGL215W 1359 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 MGR3YMR115W 1506 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 GRX3YDR098C 858 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 LST7YGR057C 729 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YIL175WYIL175W 318 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YIR014WYIR014W 729 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 RPL20BYOR312C 519 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 RPS11BYBR048W 471 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 PEP4YPL154C 1218 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YBR096WYBR096W 693 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 CDH1YGL003C 1701 nt3.16□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 CCM1YGR150C 2595 nt3.15□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 GIS4YML006C 2325 nt3.15□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 ROM1YGR070W 3468 nt3.15□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 IOC3YFR013W 2364 nt3.15□□□□□ -1.9
MSH5Q12175 YDL176WYDL176W 2127 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YGR026WYGR026W 837 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 IGO2YHR132W-A 396 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 CAB2YIL083C 1098 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YVH1YIR026C 1095 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 SEC14YMR079W 915 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 CPR8YNR028W 927 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 TAF3YPL011C 1062 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 VPS28YPL065W 729 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 SDS23YGL056C 1584 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 FRT2YAL028W 1587 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 ACK1YDL203C 1872 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 MAK21YDR060W 3078 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YPR148CYPR148C 1308 nt3.15□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YHR202WYHR202W 1809 nt3.14□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YDR089WYDR089W 2610 nt3.14□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YGR219WYGR219W 342 nt3.14□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YJR111CYJR111C 852 nt3.14□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 BUR2YLR226W 1188 nt3.14□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 OST6YML019W 999 nt3.14□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 IMP1YMR150C 573 nt3.14□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 UAF30YOR295W 687 nt3.14□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 ARO7YPR060C 771 nt3.14□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 ENA5YDR038C 3276 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 MSR1YHR091C 1932 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 CHK1YBR274W 1584 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 SAS4YDR181C 1446 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 MIX14YDR031W 366 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 SHU2YDR078C 672 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YMR141CYMR141C 309 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 DGA1YOR245C 1257 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 KAP104YBR017C 2757 nt3.13□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 HAP4YKL109W 1665 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YCL076WYCL076W 744 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 BSC2YDR275W 708 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YOS1YER074W-A 258 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 RPL13BYMR142C 600 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 OCA2YNL056W 594 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 HSH49YOR319W 642 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 ALG8YOR067C 1734 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 BCH1YMR237W 2175 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 AEP3YPL005W 1821 nt3.12□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 ARG2YJL071W 1725 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 AEP2YMR282C 1743 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 SRC1YML034W 2505 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 RPS29BYDL061C 171 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 RRP17YDR412W 708 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 LIF1YGL090W 1266 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YGR149WYGR149W 1299 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YHR069C-AYHR069C-A 363 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 IRC18YJL037W 675 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 ATP12YJL180C 978 nt3.11□□□□□ -1.91
MSH5Q12175 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.11□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 24.5 ms