Protein–RNA interactions for Protein: Q12153

SSF2, Ribosome biogenesis protein SSF2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSF2Q12153 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt5.11□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt5.11□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 FOL3YMR113W 1284 nt5.11□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 YNL057WYNL057W 333 nt5.11□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 MRP21YBL090W 534 nt5.11□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 ARL1YBR164C 552 nt5.11□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 CTP1YBR291C 900 nt5.11□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 GEM1YAL048C 1989 nt5.11□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 YGR266WYGR266W 2106 nt5.11□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 ATC1YDR184C 885 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 BUD27YFL023W 2391 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 PGD1YGL025C 1194 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 SRB5YGR104C 924 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 THS1YIL078W 2205 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 TPM1YNL079C 600 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 YGK3YOL128C 1128 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 GRX7YBR014C 612 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 RRP36YOR287C 903 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 RIB5YBR256C 717 nt5.1□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 MSN4YKL062W 1893 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 TPS3YMR261C 3165 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 SEC59YMR013C 1560 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 UBP8YMR223W 1416 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 RPL24AYGL031C 468 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 TAD1YGL243W 1203 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 REC102YLR329W 795 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 YIM1YMR152W 1098 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 HLJ1YMR161W 675 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 NRK1YNL129W 723 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 YSF3YNL138W-A 258 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 OM14YBR230C 405 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 YTA6YPL074W 2265 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 YER077CYER077C 2067 nt5.09□□□□□ -1.59
SSF2Q12153 MET12YPL023C 1974 nt5.09□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 CTT1YGR088W 1689 nt5.08□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 TRF5YNL299W 1929 nt5.08□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 LYS5YGL154C 819 nt5.08□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YGR190CYGR190C 366 nt5.08□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 PIR3YKL163W 978 nt5.08□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YAR1YPL239W 603 nt5.08□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 NCE102YPR149W 522 nt5.08□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 RFC5YBR087W 1065 nt5.08□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 IMD2YHR216W 1572 nt5.08□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 RAD18YCR066W 1464 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 BCP1YDR361C 852 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YDR491CYDR491C 492 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 PRE1YER012W 597 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YER076CYER076C 909 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 SLX8YER116C 825 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YJL175WYJL175W 513 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 PEX15YOL044W 1152 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 MCT1YOR221C 1083 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YMR221CYMR221C 1515 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 GSM1YJL103C 1857 nt5.07□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 DSN1YIR010W 1731 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 RDH54YBR073W 2877 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 snR7-SsnR7-S 179 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 TAF10YDR167W 621 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 TLG1YDR468C 675 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 RMR1YGL250W 726 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YGR160WYGR160W 612 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YIL161WYIL161W 708 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 JID1YPR061C 906 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YPR078CYPR078C 1119 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 ARC40YBR234C 1155 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 CDC37YDR168W 1521 nt5.06□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 CAF4YKR036C 1932 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 FOX2YKR009C 2703 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 PDR5YOR153W 4536 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 PCA1YBR295W 3651 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YDR248CYDR248C 582 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 ATP6Q0085 780 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 GPP1YIL053W 753 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 NKP2YLR315W 462 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 MRPL16YBL038W 699 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 POP3YNL282W 588 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 HNT3YOR258W 654 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YOR379CYOR379C 339 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 POL30YBR088C 777 nt5.05□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 LYP1YNL268W 1836 nt5.04□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YNL011CYNL011C 1335 nt5.04□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YPL109CYPL109C 1974 nt5.04□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 PGM2YMR105C 1710 nt5.04□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 RPL27AYHR010W 411 nt5.04□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 ECM13YBL043W 774 nt5.04□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 MIX23YBL107C 591 nt5.04□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 DGA1YOR245C 1257 nt5.04□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 RPS10AYOR293W 318 nt5.04□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 ROK1YGL171W 1695 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 AZR1YGR224W 1842 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 FOL2YGR267C 732 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 EFG1YGR271C-A 702 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 ECM34YHL043W 513 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 IST3YIR005W 447 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 GLO1YML004C 981 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 SGT1YOR057W 1188 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 HUT1YPL244C 1020 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 YCL002CYCL002C 792 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 POF1YCL047C 777 nt5.03□□□□□ -1.6
SSF2Q12153 NUP2YLR335W 2163 nt5.03□□□□□ -1.6
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