Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CPSF1Q10570 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CPSF1Q10570 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CPSF1Q10570 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
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