Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CGNL1Q0VF96 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CGNL1Q0VF96 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms