Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF4Q08170 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF4Q08170 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms