Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
TNK2Q07912 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNK2Q07912 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms