Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SOX4Q06945 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX4Q06945 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms