Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PAX8Q06710 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX8Q06710 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms