Protein–RNA interactions for Protein: Q05948

YLR225C, Uncharacterized SVF1-like protein YLR225C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR225CQ05948 REE1YJL217W 597 nt5□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 MCA1YOR197W 1299 nt5□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 RXT2YBR095C 1293 nt5□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 IKS1YJL057C 2004 nt5□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 PHO87YCR037C 2772 nt5□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 PCI8YIL071C 1335 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 AIM21YIR003W 2040 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 NGG1YDR176W 2109 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 GCD2YGR083C 1956 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 RPC11YDR045C 333 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YGL185CYGL185C 1140 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 RPS25AYGR027C 327 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 PTI1YGR156W 1278 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 TRX2YGR209C 315 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 AIM22YJL046W 1230 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YJL193WYJL193W 1209 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 SRP40YKR092C 1221 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YMR144WYMR144W 1029 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 RET3YPL010W 570 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 snR32snR32 188 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 UBP10YNL186W 2379 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 IMD3YLR432W 1572 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YOR365CYOR365C 2112 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 GAD1YMR250W 1758 nt4.99□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 CUE3YGL110C 1875 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 GCD1YOR260W 1737 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YER076CYER076C 909 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YIL165CYIL165C 360 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 SYS1YJL004C 612 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 VMA5YKL080W 1179 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 CNB1YKL190W 528 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 GRX7YBR014C 612 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 TOA1YOR194C 861 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 NIP7YPL211W 546 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 MCM2YBL023C 2607 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 BUD22YMR014W 1560 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YML020WYML020W 1995 nt4.98□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 TUB3YML124C 1338 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 RVB1YDR190C 1392 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 NTA1YJR062C 1374 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 AIM7YDR063W 450 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YGL159WYGL159W 1113 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 GTF1YGR102C 552 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 VMA21YGR105W 234 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 BET4YJL031C 984 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 PHO86YJL117W 936 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YJR157WYJR157W 363 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 YMR196WYMR196W 3267 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 VTC2YFL004W 2487 nt4.97□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 SUP35YDR172W 2058 nt4.96□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 GEM1YAL048C 1989 nt4.96□□□□□ -1.61
YLR225CQ05948 KIN2YLR096W 3444 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 MFB1YDR219C 1398 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 TGL2YDR058C 981 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 UBC13YDR092W 462 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 TVP15YDR100W 432 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 BSC2YDR275W 708 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 YGR026WYGR026W 837 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 YJL007CYJL007C 315 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 RPS1BYML063W 768 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 IRC21YMR073C 606 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 CTP1YBR291C 900 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 MET12YPL023C 1974 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 UBX5YDR330W 1503 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 SPR3YGR059W 1539 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 NGL2YMR285C 1548 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 CST9YLR394W 1449 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 FMP30YPL103C 1407 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 MNN2YBR015C 1794 nt4.96□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 HCA4YJL033W 2313 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 RRN3YKL125W 1884 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 snR84snR84 550 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 DIG2YDR480W 972 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 YLR050CYLR050C 486 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 HTA2YBL003C 399 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 YMR310CYMR310C 954 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 MET31YPL038W 534 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 RAD53YPL153C 2466 nt4.95□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 RIM15YFL033C 5313 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 HUL4YJR036C 2679 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 NOP56YLR197W 1515 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 YAP6YDR259C 1152 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 TMA20YER007C-A 546 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 THG1YGR024C 714 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 RNR2YJL026W 1200 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 ATG27YJL178C 816 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 YJR020WYJR020W 333 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 ECI1YLR284C 843 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 RLP7YNL002C 969 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 NRM1YNR009W 750 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 SPC29YPL124W 762 nt4.94□□□□□ -1.62
YLR225CQ05948 CDC5YMR001C 2118 nt4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.6 ms