Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRB3Q04118 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms