Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID5AQ03989 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID5AQ03989 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms