Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CAV1Q03135 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CAV1Q03135 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms