Protein–RNA interactions for Protein: Q02978

SLC25A11, Mitochondrial 2-oxoglutarate/malate carrier protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A11Q02978 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC25A11Q02978 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC25A11Q02978 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms