Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ID3Q02535 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ID3Q02535 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ID3Q02535 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ID3Q02535 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ID3Q02535 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ID3Q02535 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ID3Q02535 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ID3Q02535 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ID3Q02535 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ID3Q02535 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ID3Q02535 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ID3Q02535 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms