Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLCB3Q01970 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLCB3Q01970 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms