Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BNC1Q01954 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BNC1Q01954 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.33■■□□□ 1
BNC1Q01954 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
BNC1Q01954 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BNC1Q01954 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
BNC1Q01954 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
BNC1Q01954 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms