Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MDM2Q00987 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MDM2Q00987 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MDM2Q00987 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms