Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FANCCQ00597 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FANCCQ00597 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms