Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK16Q00536 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms