Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HPCAP84074 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HPCAP84074 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HPCAP84074 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HPCAP84074 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HPCAP84074 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HPCAP84074 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HPCAP84074 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HPCAP84074 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms