Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP2P81877 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SSBP2P81877 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms