Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP2P78314 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP2P78314 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2P78314 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms