Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBXN2AP68543 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBXN2AP68543 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms