Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GNB1P62873 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GNB1P62873 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GNB1P62873 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GNB1P62873 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms