Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERVK_113P61574 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HERVK_113P61574 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms