Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00315P59091 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms