Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SH3BGRP55822 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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