Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC12A2P55011 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC12A2P55011 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms