Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATN1P54259 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATN1P54259 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATN1P54259 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATN1P54259 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATN1P54259 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATN1P54259 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATN1P54259 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATN1P54259 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATN1P54259 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATN1P54259 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ATN1P54259 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATN1P54259 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATN1P54259 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATN1P54259 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATN1P54259 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATN1P54259 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATN1P54259 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATN1P54259 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATN1P54259 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATN1P54259 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATN1P54259 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATN1P54259 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATN1P54259 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATN1P54259 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATN1P54259 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATN1P54259 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATN1P54259 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATN1P54259 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATN1P54259 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATN1P54259 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATN1P54259 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms