Protein–RNA interactions for Protein: P53708

ITGA8, Integrin alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA8P53708 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGA8P53708 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA8P53708 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms