Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LIMK1P53667 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIMK1P53667 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LIMK1P53667 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LIMK1P53667 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LIMK1P53667 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK1P53667 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK1P53667 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK1P53667 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK1P53667 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK1P53667 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK1P53667 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LIMK1P53667 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms