Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EFNA3P52797 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EFNA3P52797 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms