Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RND2P52198 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RND2P52198 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RND2P52198 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RND2P52198 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RND2P52198 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms