Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LUMP51884 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LUMP51884 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LUMP51884 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LUMP51884 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LUMP51884 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LUMP51884 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LUMP51884 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LUMP51884 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LUMP51884 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LUMP51884 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LUMP51884 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
LUMP51884 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LUMP51884 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LUMP51884 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LUMP51884 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms